变形联盟和海澄合力击败敌人，平溪市再次回归和御灵真仙。然而时空能量异常波动情况却愈演愈烈，导致现实世界与平行宇宙发生交错产生了时空歧点，时空兽也随之出现。就在变形联盟忙于对付时空兽修复时空歧点时，茜卡与双子星汇合，策划了一系列针对变形联盟和平溪市的侵袭行动，也趁乱夺走沉睡在基地中的虫王卵。阻止时空错乱，抵抗浩肯星侵袭，面对双重压力和危机，变形联盟和海澄毫不退缩。但在一连串的强攻之下众人逐渐失去自我...

基因石能量渐渐恢复成基因石，且显露出更强大的力量、更多不为人知的秘无限之作弊修仙。反派势必不会轻易罢休，将以更强大的姿态卷土重来。但在艰难的挑战中，普力士等人仍看到了希望：宇宙中，分散著为数不明的「变形联盟战士」，这群代表正义的首领勇士若聚集起来，将会成为一股巨流，一起勇敢地为守护地球而战！...